生物质锅炉因为燃烧物的特点，比燃煤锅炉在环保方面要优越的多，燃煤锅炉的炉膛相比生物质锅炉要小的多，生物质锅炉因为炉膛比较大，并且二次吹风燃烧，可以使得生物质锅炉的效率达到80%以上。

无锡太湖锅炉有限公司认为生物质锅炉如果想要避免污染，并实现环保排放的话，那么是可以在锅炉中采取一些措施的，比如，在锅炉后部布置具有螺旋的出渣机，以便来实现连续清灰。还有，在锅炉尾部的烟道中布置除尘器，从而保证烟尘排放能够达标，从而避免环境污染等。

在结构设计上，与传统的锅炉相比，是有较大的炉膛空间，而内部二次风布置合理，这样可以有利于生物质的充分燃烧。此外，其在燃烧设备上，是采用了往复排炉，这样可以保证燃烧效果。